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正在研究速生树木,尤其是杨树,因为它们每单位面积产生大量生物量。杨树和柳树是生物燃料作物的主要候选对象,当可以有效地提取糖分时,它们有望生产纤维素乙醇和高能含量的燃料。
我们的非树专家会惊讶于桃子,苹果,草莓,樱桃和杏仁以及许多其他植物,包括美丽而浪漫的玫瑰,都成为了这个玫瑰家族的一员。这意味着他们共享大部分遗传密码。
科学家们已经转向我们长期驯化的果树,以获取研究树木的蔷薇科超家族的生理学和遗传学的线索。
美国能源部联合基因组研究所(DOE JGI)植物项目负责人杰里米·施穆茨(Jeremy Schmutz)表示:“桃和杨树之间的密切关系从它们的DNA序列中可以明显看出。”
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对于3月24日的《自然遗传学》杂志,Schmutz和国际桃子基因组计划(IPGI)的几位同事发表了2.65亿个李子李的基本基因组。
克莱姆森大学的这棵Lovell桃树提供了用于确定桃基因组的DNA。图片来源:克莱姆森大学。
该论文的作者说:“使用比较基因组学方法,桃子序列的表征不仅可以用于改善桃子和其他重要树种的可持续性,还可以增进我们对树种基本生物学的理解。”
研究小组将141个桃子基因家族与其他六个完全测序的不同植物物种的家族进行了比较,以揭示独特的代谢途径。他们已经了解到例如哪些代谢途径导致了木质素的生物合成(将植物细胞保持在一起的分子“胶水”),并且是将生物质分解为燃料的主要障碍。
对于生物能源研究人员而言,桃子基因组的大小使其非常适合用作研究相关基因组(例如杨树)中发现的基因的植物模型,并开发提高生物燃料的植物生物量产量的方法。
美国能源部JGI真核计划负责人Daniel Rokhsar在其领导下的桃子基因组测序始于2007年,这使我们更加深入地了解了这一点,“一个令人感兴趣的基因是桃子中的所谓“常绿”基因座,从而延长了生长期。从理论上讲,可以在杨树中对其进行处理以增加生物量的积累。
可能不会花很长时间;杨树是美国能源部JGI植物旗舰基因组之一,使杨树的发展成为第一要务。
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它似乎进展缓慢。在国际桃子基因组协会在DOE JGI Plant门户网站Phytozome.net和其他网站上公开发布带注释的桃子基因组草案三年之后,该论文才发表。桃子基因组测序的决定是在2007年动植物基因组XI大会上首次宣布的。
不管该项目如何进行,一长串的蔷薇科超家族植物正在极大地促进遗传信息的产生,从而使人们对我们的健康树果实倍加爱戴和非常重要,从而使其更加高效。不论是用作工具燃料还是用于人体燃料,超强腐蚀性能都是提高生产率的开始。
值得一提的是,支持来自美国能源部科学技术办公室,由美国能源部JGI,哈德逊阿尔法生物技术研究所,克莱姆森大学,北卡罗来纳州立大学和华盛顿州立大学的研究人员领导。多数民众赞成在桃和苹果的国家。
美国农业部和加州大学伯克利分校的能源生物科学研究所也提供了额外的支持,他们为高级作者特蕾丝·米特罗斯(Therese Mitros)提供了支持。意大利政府也支持这项国际努力,包括意大利罗马果树研究中心/农业研究理事会的第一作者Ignazio Verde的工作。
参与者的范围包括智利,西班牙和法国的研究机构也做出的贡献。这绝对是国际努力。
无论未来如何,基因组的释放将对重要的水果食品生产和燃料生产产生巨大影响。令人欣喜的消息是,很高兴看到如此广泛的参与,并希望进一步扩大对人们的惠益。
通过。布莱恩·韦斯滕豪斯
原始资料:果树燃料
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